Protein–RNA interactions for Protein: E0CXF8

BC035044, cDNA sequence BC035044, mousemouse

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035044E0CXF8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BC035044E0CXF8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms