Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5L6

Slc18b1, MFS-type transporter SLC18B1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18b1D3Z5L6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc18b1D3Z5L6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms