Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1D3

3425401B19Rik, RIKEN cDNA 3425401B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3425401B19RikD3Z1D3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
3425401B19RikD3Z1D3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
3425401B19RikD3Z1D3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
3425401B19RikD3Z1D3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
3425401B19RikD3Z1D3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
3425401B19RikD3Z1D3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
3425401B19RikD3Z1D3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
3425401B19RikD3Z1D3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
3425401B19RikD3Z1D3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
3425401B19RikD3Z1D3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
3425401B19RikD3Z1D3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
3425401B19RikD3Z1D3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
3425401B19RikD3Z1D3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
3425401B19RikD3Z1D3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
3425401B19RikD3Z1D3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
3425401B19RikD3Z1D3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
3425401B19RikD3Z1D3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
3425401B19RikD3Z1D3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
3425401B19RikD3Z1D3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
3425401B19RikD3Z1D3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
3425401B19RikD3Z1D3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
3425401B19RikD3Z1D3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
3425401B19RikD3Z1D3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
3425401B19RikD3Z1D3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
3425401B19RikD3Z1D3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
3425401B19RikD3Z1D3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
3425401B19RikD3Z1D3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
3425401B19RikD3Z1D3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
3425401B19RikD3Z1D3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
3425401B19RikD3Z1D3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
3425401B19RikD3Z1D3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
3425401B19RikD3Z1D3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
3425401B19RikD3Z1D3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
3425401B19RikD3Z1D3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
3425401B19RikD3Z1D3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
3425401B19RikD3Z1D3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
3425401B19RikD3Z1D3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
3425401B19RikD3Z1D3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
3425401B19RikD3Z1D3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
3425401B19RikD3Z1D3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
3425401B19RikD3Z1D3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
3425401B19RikD3Z1D3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
3425401B19RikD3Z1D3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
3425401B19RikD3Z1D3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
3425401B19RikD3Z1D3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
3425401B19RikD3Z1D3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
3425401B19RikD3Z1D3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
3425401B19RikD3Z1D3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
3425401B19RikD3Z1D3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
3425401B19RikD3Z1D3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
3425401B19RikD3Z1D3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
3425401B19RikD3Z1D3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
3425401B19RikD3Z1D3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
3425401B19RikD3Z1D3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
3425401B19RikD3Z1D3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
3425401B19RikD3Z1D3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
3425401B19RikD3Z1D3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
3425401B19RikD3Z1D3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
3425401B19RikD3Z1D3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
3425401B19RikD3Z1D3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
3425401B19RikD3Z1D3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
3425401B19RikD3Z1D3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
3425401B19RikD3Z1D3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
3425401B19RikD3Z1D3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
3425401B19RikD3Z1D3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
3425401B19RikD3Z1D3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
3425401B19RikD3Z1D3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
3425401B19RikD3Z1D3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
3425401B19RikD3Z1D3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
3425401B19RikD3Z1D3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
3425401B19RikD3Z1D3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
3425401B19RikD3Z1D3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
3425401B19RikD3Z1D3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
3425401B19RikD3Z1D3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
3425401B19RikD3Z1D3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
3425401B19RikD3Z1D3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
3425401B19RikD3Z1D3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
3425401B19RikD3Z1D3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
3425401B19RikD3Z1D3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
3425401B19RikD3Z1D3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
3425401B19RikD3Z1D3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
3425401B19RikD3Z1D3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
3425401B19RikD3Z1D3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
3425401B19RikD3Z1D3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
3425401B19RikD3Z1D3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
3425401B19RikD3Z1D3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
3425401B19RikD3Z1D3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
3425401B19RikD3Z1D3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
3425401B19RikD3Z1D3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
3425401B19RikD3Z1D3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
3425401B19RikD3Z1D3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
3425401B19RikD3Z1D3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
3425401B19RikD3Z1D3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
3425401B19RikD3Z1D3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
3425401B19RikD3Z1D3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
3425401B19RikD3Z1D3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
3425401B19RikD3Z1D3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
3425401B19RikD3Z1D3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
3425401B19RikD3Z1D3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms