Protein–RNA interactions for Protein: D3YY23

Lonrf1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf1D3YY23 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lonrf1D3YY23 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lonrf1D3YY23 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lonrf1D3YY23 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lonrf1D3YY23 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lonrf1D3YY23 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lonrf1D3YY23 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lonrf1D3YY23 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lonrf1D3YY23 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lonrf1D3YY23 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lonrf1D3YY23 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lonrf1D3YY23 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lonrf1D3YY23 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lonrf1D3YY23 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lonrf1D3YY23 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lonrf1D3YY23 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lonrf1D3YY23 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lonrf1D3YY23 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lonrf1D3YY23 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lonrf1D3YY23 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lonrf1D3YY23 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lonrf1D3YY23 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lonrf1D3YY23 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lonrf1D3YY23 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lonrf1D3YY23 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lonrf1D3YY23 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lonrf1D3YY23 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lonrf1D3YY23 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lonrf1D3YY23 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lonrf1D3YY23 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lonrf1D3YY23 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lonrf1D3YY23 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lonrf1D3YY23 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lonrf1D3YY23 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lonrf1D3YY23 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lonrf1D3YY23 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lonrf1D3YY23 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lonrf1D3YY23 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lonrf1D3YY23 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lonrf1D3YY23 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lonrf1D3YY23 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lonrf1D3YY23 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lonrf1D3YY23 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lonrf1D3YY23 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lonrf1D3YY23 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lonrf1D3YY23 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lonrf1D3YY23 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lonrf1D3YY23 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lonrf1D3YY23 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lonrf1D3YY23 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lonrf1D3YY23 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lonrf1D3YY23 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lonrf1D3YY23 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lonrf1D3YY23 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lonrf1D3YY23 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lonrf1D3YY23 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lonrf1D3YY23 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Lonrf1D3YY23 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lonrf1D3YY23 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lonrf1D3YY23 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lonrf1D3YY23 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lonrf1D3YY23 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lonrf1D3YY23 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lonrf1D3YY23 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lonrf1D3YY23 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lonrf1D3YY23 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lonrf1D3YY23 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lonrf1D3YY23 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lonrf1D3YY23 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lonrf1D3YY23 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lonrf1D3YY23 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lonrf1D3YY23 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lonrf1D3YY23 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lonrf1D3YY23 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lonrf1D3YY23 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lonrf1D3YY23 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lonrf1D3YY23 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lonrf1D3YY23 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lonrf1D3YY23 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lonrf1D3YY23 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lonrf1D3YY23 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lonrf1D3YY23 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lonrf1D3YY23 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lonrf1D3YY23 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lonrf1D3YY23 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lonrf1D3YY23 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lonrf1D3YY23 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lonrf1D3YY23 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lonrf1D3YY23 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lonrf1D3YY23 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lonrf1D3YY23 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lonrf1D3YY23 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lonrf1D3YY23 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lonrf1D3YY23 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lonrf1D3YY23 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lonrf1D3YY23 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lonrf1D3YY23 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lonrf1D3YY23 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lonrf1D3YY23 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lonrf1D3YY23 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms