Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SafbD3YXK2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SafbD3YXK2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SafbD3YXK2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SafbD3YXK2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SafbD3YXK2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SafbD3YXK2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SafbD3YXK2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SafbD3YXK2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SafbD3YXK2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SafbD3YXK2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SafbD3YXK2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SafbD3YXK2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SafbD3YXK2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SafbD3YXK2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SafbD3YXK2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SafbD3YXK2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SafbD3YXK2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SafbD3YXK2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SafbD3YXK2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SafbD3YXK2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SafbD3YXK2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SafbD3YXK2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SafbD3YXK2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SafbD3YXK2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SafbD3YXK2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SafbD3YXK2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SafbD3YXK2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SafbD3YXK2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SafbD3YXK2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SafbD3YXK2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SafbD3YXK2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SafbD3YXK2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SafbD3YXK2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SafbD3YXK2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SafbD3YXK2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SafbD3YXK2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SafbD3YXK2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SafbD3YXK2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SafbD3YXK2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SafbD3YXK2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SafbD3YXK2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SafbD3YXK2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SafbD3YXK2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SafbD3YXK2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SafbD3YXK2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SafbD3YXK2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SafbD3YXK2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SafbD3YXK2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SafbD3YXK2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SafbD3YXK2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SafbD3YXK2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SafbD3YXK2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SafbD3YXK2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SafbD3YXK2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SafbD3YXK2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SafbD3YXK2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SafbD3YXK2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SafbD3YXK2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SafbD3YXK2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SafbD3YXK2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SafbD3YXK2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SafbD3YXK2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SafbD3YXK2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SafbD3YXK2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SafbD3YXK2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SafbD3YXK2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SafbD3YXK2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SafbD3YXK2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SafbD3YXK2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SafbD3YXK2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SafbD3YXK2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SafbD3YXK2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SafbD3YXK2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SafbD3YXK2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SafbD3YXK2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SafbD3YXK2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SafbD3YXK2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SafbD3YXK2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SafbD3YXK2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SafbD3YXK2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SafbD3YXK2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SafbD3YXK2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SafbD3YXK2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SafbD3YXK2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SafbD3YXK2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SafbD3YXK2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SafbD3YXK2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SafbD3YXK2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SafbD3YXK2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SafbD3YXK2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SafbD3YXK2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SafbD3YXK2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SafbD3YXK2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SafbD3YXK2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SafbD3YXK2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SafbD3YXK2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SafbD3YXK2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SafbD3YXK2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SafbD3YXK2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms