Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BC048679D3YXE9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BC048679D3YXE9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BC048679D3YXE9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BC048679D3YXE9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BC048679D3YXE9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BC048679D3YXE9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BC048679D3YXE9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BC048679D3YXE9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BC048679D3YXE9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BC048679D3YXE9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BC048679D3YXE9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BC048679D3YXE9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BC048679D3YXE9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BC048679D3YXE9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BC048679D3YXE9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BC048679D3YXE9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BC048679D3YXE9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BC048679D3YXE9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BC048679D3YXE9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BC048679D3YXE9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BC048679D3YXE9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC048679D3YXE9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BC048679D3YXE9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC048679D3YXE9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC048679D3YXE9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC048679D3YXE9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BC048679D3YXE9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC048679D3YXE9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC048679D3YXE9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BC048679D3YXE9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC048679D3YXE9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC048679D3YXE9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC048679D3YXE9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC048679D3YXE9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BC048679D3YXE9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC048679D3YXE9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC048679D3YXE9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC048679D3YXE9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BC048679D3YXE9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BC048679D3YXE9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC048679D3YXE9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC048679D3YXE9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC048679D3YXE9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC048679D3YXE9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC048679D3YXE9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC048679D3YXE9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BC048679D3YXE9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC048679D3YXE9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BC048679D3YXE9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BC048679D3YXE9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BC048679D3YXE9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC048679D3YXE9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BC048679D3YXE9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BC048679D3YXE9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC048679D3YXE9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC048679D3YXE9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC048679D3YXE9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC048679D3YXE9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC048679D3YXE9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC048679D3YXE9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC048679D3YXE9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC048679D3YXE9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC048679D3YXE9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BC048679D3YXE9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC048679D3YXE9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
BC048679D3YXE9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
BC048679D3YXE9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
BC048679D3YXE9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms