Protein–RNA interactions for Protein: D3YVL2

Cfap70, Cilia and flagella-associated protein 70, mousemouse

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap70D3YVL2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cfap70D3YVL2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cfap70D3YVL2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cfap70D3YVL2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cfap70D3YVL2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cfap70D3YVL2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cfap70D3YVL2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cfap70D3YVL2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cfap70D3YVL2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cfap70D3YVL2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cfap70D3YVL2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cfap70D3YVL2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cfap70D3YVL2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cfap70D3YVL2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cfap70D3YVL2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cfap70D3YVL2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cfap70D3YVL2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cfap70D3YVL2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cfap70D3YVL2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cfap70D3YVL2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cfap70D3YVL2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cfap70D3YVL2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms