Protein–RNA interactions for Protein: B9EKE5

Catip, Ciliogenesis-associated TTC17-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatipB9EKE5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CatipB9EKE5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CatipB9EKE5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CatipB9EKE5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CatipB9EKE5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CatipB9EKE5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CatipB9EKE5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CatipB9EKE5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CatipB9EKE5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CatipB9EKE5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CatipB9EKE5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CatipB9EKE5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CatipB9EKE5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CatipB9EKE5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CatipB9EKE5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CatipB9EKE5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CatipB9EKE5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CatipB9EKE5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CatipB9EKE5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CatipB9EKE5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CatipB9EKE5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CatipB9EKE5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CatipB9EKE5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CatipB9EKE5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CatipB9EKE5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CatipB9EKE5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CatipB9EKE5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CatipB9EKE5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CatipB9EKE5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CatipB9EKE5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CatipB9EKE5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CatipB9EKE5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CatipB9EKE5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms