Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms