Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20547B8JJN0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20547B8JJN0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20547B8JJN0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20547B8JJN0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20547B8JJN0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20547B8JJN0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20547B8JJN0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20547B8JJN0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20547B8JJN0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20547B8JJN0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20547B8JJN0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20547B8JJN0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20547B8JJN0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20547B8JJN0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20547B8JJN0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20547B8JJN0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20547B8JJN0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20547B8JJN0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20547B8JJN0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20547B8JJN0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20547B8JJN0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20547B8JJN0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20547B8JJN0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20547B8JJN0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20547B8JJN0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20547B8JJN0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20547B8JJN0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms