Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms