Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC1

Trappc11, Trafficking protein particle complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc11B2RXC1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trappc11B2RXC1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trappc11B2RXC1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trappc11B2RXC1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc11B2RXC1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc11B2RXC1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc11B2RXC1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc11B2RXC1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc11B2RXC1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc11B2RXC1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc11B2RXC1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc11B2RXC1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc11B2RXC1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc11B2RXC1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc11B2RXC1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc11B2RXC1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc11B2RXC1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc11B2RXC1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc11B2RXC1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms