Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms