Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms