Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms