Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Usf3B2RUQ2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Usf3B2RUQ2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Usf3B2RUQ2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Usf3B2RUQ2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Usf3B2RUQ2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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