Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms