Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms