Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN2

Igsf23, Immunoglobulin superfamily, member 23, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf23B2RTN2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Igsf23B2RTN2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Igsf23B2RTN2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Igsf23B2RTN2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Igsf23B2RTN2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Igsf23B2RTN2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Igsf23B2RTN2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Igsf23B2RTN2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Igsf23B2RTN2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igsf23B2RTN2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igsf23B2RTN2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igsf23B2RTN2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igsf23B2RTN2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igsf23B2RTN2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Igsf23B2RTN2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igsf23B2RTN2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igsf23B2RTN2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igsf23B2RTN2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igsf23B2RTN2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igsf23B2RTN2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igsf23B2RTN2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Igsf23B2RTN2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igsf23B2RTN2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igsf23B2RTN2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igsf23B2RTN2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Igsf23B2RTN2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igsf23B2RTN2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igsf23B2RTN2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Igsf23B2RTN2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igsf23B2RTN2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igsf23B2RTN2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Igsf23B2RTN2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Igsf23B2RTN2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Igsf23B2RTN2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Igsf23B2RTN2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Igsf23B2RTN2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Igsf23B2RTN2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Igsf23B2RTN2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Igsf23B2RTN2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Igsf23B2RTN2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Igsf23B2RTN2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Igsf23B2RTN2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Igsf23B2RTN2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Igsf23B2RTN2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Igsf23B2RTN2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Igsf23B2RTN2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Igsf23B2RTN2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Igsf23B2RTN2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Igsf23B2RTN2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Igsf23B2RTN2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Igsf23B2RTN2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Igsf23B2RTN2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Igsf23B2RTN2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Igsf23B2RTN2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Igsf23B2RTN2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Igsf23B2RTN2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Igsf23B2RTN2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Igsf23B2RTN2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Igsf23B2RTN2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Igsf23B2RTN2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Igsf23B2RTN2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Igsf23B2RTN2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Igsf23B2RTN2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.14■□□□□ 0.02
Igsf23B2RTN2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igsf23B2RTN2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igsf23B2RTN2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igsf23B2RTN2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igsf23B2RTN2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igsf23B2RTN2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igsf23B2RTN2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igsf23B2RTN2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igsf23B2RTN2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igsf23B2RTN2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igsf23B2RTN2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igsf23B2RTN2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igsf23B2RTN2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igsf23B2RTN2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igsf23B2RTN2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igsf23B2RTN2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Igsf23B2RTN2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igsf23B2RTN2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igsf23B2RTN2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igsf23B2RTN2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igsf23B2RTN2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igsf23B2RTN2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igsf23B2RTN2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igsf23B2RTN2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Igsf23B2RTN2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Igsf23B2RTN2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Igsf23B2RTN2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Igsf23B2RTN2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Igsf23B2RTN2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Igsf23B2RTN2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Igsf23B2RTN2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Igsf23B2RTN2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Igsf23B2RTN2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Igsf23B2RTN2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Igsf23B2RTN2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Igsf23B2RTN2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Igsf23B2RTN2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms