Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrn3B2RS91 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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