Protein–RNA interactions for Protein: B1AYB6

Mbd5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd5B1AYB6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Mbd5B1AYB6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Mbd5B1AYB6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Mbd5B1AYB6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Mbd5B1AYB6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Mbd5B1AYB6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Mbd5B1AYB6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Mbd5B1AYB6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mbd5B1AYB6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mbd5B1AYB6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mbd5B1AYB6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mbd5B1AYB6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mbd5B1AYB6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mbd5B1AYB6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mbd5B1AYB6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mbd5B1AYB6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mbd5B1AYB6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mbd5B1AYB6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mbd5B1AYB6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mbd5B1AYB6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mbd5B1AYB6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mbd5B1AYB6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Mbd5B1AYB6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mbd5B1AYB6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mbd5B1AYB6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mbd5B1AYB6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mbd5B1AYB6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mbd5B1AYB6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mbd5B1AYB6 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mbd5B1AYB6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mbd5B1AYB6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mbd5B1AYB6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Mbd5B1AYB6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Mbd5B1AYB6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mbd5B1AYB6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mbd5B1AYB6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mbd5B1AYB6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mbd5B1AYB6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mbd5B1AYB6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Mbd5B1AYB6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mbd5B1AYB6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mbd5B1AYB6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mbd5B1AYB6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mbd5B1AYB6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mbd5B1AYB6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mbd5B1AYB6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mbd5B1AYB6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mbd5B1AYB6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mbd5B1AYB6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mbd5B1AYB6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Mbd5B1AYB6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mbd5B1AYB6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mbd5B1AYB6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mbd5B1AYB6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mbd5B1AYB6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mbd5B1AYB6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mbd5B1AYB6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mbd5B1AYB6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Mbd5B1AYB6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Mbd5B1AYB6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mbd5B1AYB6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mbd5B1AYB6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mbd5B1AYB6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mbd5B1AYB6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mbd5B1AYB6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mbd5B1AYB6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mbd5B1AYB6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mbd5B1AYB6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mbd5B1AYB6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mbd5B1AYB6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mbd5B1AYB6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mbd5B1AYB6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mbd5B1AYB6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mbd5B1AYB6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mbd5B1AYB6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mbd5B1AYB6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mbd5B1AYB6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mbd5B1AYB6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mbd5B1AYB6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mbd5B1AYB6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mbd5B1AYB6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Mbd5B1AYB6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mbd5B1AYB6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Mbd5B1AYB6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mbd5B1AYB6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mbd5B1AYB6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mbd5B1AYB6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mbd5B1AYB6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mbd5B1AYB6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mbd5B1AYB6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mbd5B1AYB6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mbd5B1AYB6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mbd5B1AYB6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mbd5B1AYB6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mbd5B1AYB6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mbd5B1AYB6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mbd5B1AYB6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mbd5B1AYB6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mbd5B1AYB6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mbd5B1AYB6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms