Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms