Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NhsB1AV60 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NhsB1AV60 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NhsB1AV60 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NhsB1AV60 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NhsB1AV60 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NhsB1AV60 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NhsB1AV60 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NhsB1AV60 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NhsB1AV60 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NhsB1AV60 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NhsB1AV60 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NhsB1AV60 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NhsB1AV60 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NhsB1AV60 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NhsB1AV60 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NhsB1AV60 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NhsB1AV60 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NhsB1AV60 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NhsB1AV60 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
NhsB1AV60 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NhsB1AV60 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NhsB1AV60 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NhsB1AV60 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
NhsB1AV60 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NhsB1AV60 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NhsB1AV60 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NhsB1AV60 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NhsB1AV60 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NhsB1AV60 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NhsB1AV60 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NhsB1AV60 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NhsB1AV60 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NhsB1AV60 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NhsB1AV60 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NhsB1AV60 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NhsB1AV60 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NhsB1AV60 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NhsB1AV60 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NhsB1AV60 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NhsB1AV60 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NhsB1AV60 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NhsB1AV60 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NhsB1AV60 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NhsB1AV60 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NhsB1AV60 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NhsB1AV60 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NhsB1AV60 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NhsB1AV60 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NhsB1AV60 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NhsB1AV60 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NhsB1AV60 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NhsB1AV60 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NhsB1AV60 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NhsB1AV60 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NhsB1AV60 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NhsB1AV60 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NhsB1AV60 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NhsB1AV60 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NhsB1AV60 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NhsB1AV60 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NhsB1AV60 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NhsB1AV60 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NhsB1AV60 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NhsB1AV60 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NhsB1AV60 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NhsB1AV60 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NhsB1AV60 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NhsB1AV60 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NhsB1AV60 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NhsB1AV60 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NhsB1AV60 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
NhsB1AV60 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
NhsB1AV60 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NhsB1AV60 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NhsB1AV60 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NhsB1AV60 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NhsB1AV60 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NhsB1AV60 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NhsB1AV60 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NhsB1AV60 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NhsB1AV60 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NhsB1AV60 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NhsB1AV60 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NhsB1AV60 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NhsB1AV60 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NhsB1AV60 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NhsB1AV60 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NhsB1AV60 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NhsB1AV60 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NhsB1AV60 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NhsB1AV60 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NhsB1AV60 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NhsB1AV60 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NhsB1AV60 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NhsB1AV60 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NhsB1AV60 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NhsB1AV60 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NhsB1AV60 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NhsB1AV60 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms