Protein–RNA interactions for Protein: B1AUH1

Ptpru, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpruB1AUH1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtpruB1AUH1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtpruB1AUH1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtpruB1AUH1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtpruB1AUH1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtpruB1AUH1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtpruB1AUH1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtpruB1AUH1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtpruB1AUH1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtpruB1AUH1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtpruB1AUH1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtpruB1AUH1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtpruB1AUH1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtpruB1AUH1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtpruB1AUH1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtpruB1AUH1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PtpruB1AUH1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PtpruB1AUH1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtpruB1AUH1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtpruB1AUH1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtpruB1AUH1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PtpruB1AUH1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtpruB1AUH1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtpruB1AUH1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtpruB1AUH1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PtpruB1AUH1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtpruB1AUH1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtpruB1AUH1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtpruB1AUH1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PtpruB1AUH1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtpruB1AUH1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtpruB1AUH1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtpruB1AUH1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PtpruB1AUH1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtpruB1AUH1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtpruB1AUH1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PtpruB1AUH1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtpruB1AUH1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtpruB1AUH1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtpruB1AUH1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtpruB1AUH1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtpruB1AUH1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtpruB1AUH1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtpruB1AUH1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtpruB1AUH1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtpruB1AUH1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtpruB1AUH1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtpruB1AUH1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtpruB1AUH1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtpruB1AUH1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtpruB1AUH1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtpruB1AUH1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtpruB1AUH1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtpruB1AUH1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtpruB1AUH1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtpruB1AUH1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtpruB1AUH1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtpruB1AUH1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PtpruB1AUH1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtpruB1AUH1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtpruB1AUH1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtpruB1AUH1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtpruB1AUH1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtpruB1AUH1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtpruB1AUH1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PtpruB1AUH1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtpruB1AUH1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PtpruB1AUH1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PtpruB1AUH1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
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