Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms