Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slfn8B1ARD8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slfn8B1ARD8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slfn8B1ARD8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slfn8B1ARD8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slfn8B1ARD8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slfn8B1ARD8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slfn8B1ARD8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slfn8B1ARD8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slfn8B1ARD8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slfn8B1ARD8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slfn8B1ARD8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slfn8B1ARD8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slfn8B1ARD8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slfn8B1ARD8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slfn8B1ARD8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slfn8B1ARD8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slfn8B1ARD8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slfn8B1ARD8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slfn8B1ARD8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slfn8B1ARD8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slfn8B1ARD8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slfn8B1ARD8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slfn8B1ARD8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slfn8B1ARD8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slfn8B1ARD8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slfn8B1ARD8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slfn8B1ARD8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slfn8B1ARD8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slfn8B1ARD8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slfn8B1ARD8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slfn8B1ARD8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slfn8B1ARD8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slfn8B1ARD8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slfn8B1ARD8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slfn8B1ARD8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slfn8B1ARD8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slfn8B1ARD8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slfn8B1ARD8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slfn8B1ARD8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slfn8B1ARD8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slfn8B1ARD8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slfn8B1ARD8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slfn8B1ARD8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slfn8B1ARD8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slfn8B1ARD8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slfn8B1ARD8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slfn8B1ARD8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slfn8B1ARD8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slfn8B1ARD8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slfn8B1ARD8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slfn8B1ARD8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slfn8B1ARD8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slfn8B1ARD8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slfn8B1ARD8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slfn8B1ARD8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slfn8B1ARD8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slfn8B1ARD8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Slfn8B1ARD8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slfn8B1ARD8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slfn8B1ARD8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slfn8B1ARD8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms