Protein–RNA interactions for Protein: B1AQJ2

Usp36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,098 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp36B1AQJ2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms