Protein–RNA interactions for Protein: A7XUX6

Skint2, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint2A7XUX6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Skint2A7XUX6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Skint2A7XUX6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Skint2A7XUX6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Skint2A7XUX6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Skint2A7XUX6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint2A7XUX6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint2A7XUX6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint2A7XUX6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint2A7XUX6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint2A7XUX6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint2A7XUX6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint2A7XUX6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint2A7XUX6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint2A7XUX6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint2A7XUX6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint2A7XUX6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint2A7XUX6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint2A7XUX6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint2A7XUX6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint2A7XUX6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint2A7XUX6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint2A7XUX6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint2A7XUX6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint2A7XUX6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint2A7XUX6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Skint2A7XUX6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Skint2A7XUX6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms