Protein–RNA interactions for Protein: A2RT60

Htra4, Serine protease HTRA4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra4A2RT60 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms