Protein–RNA interactions for Protein: A2RSY6

Trmt1l, TRMT1-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt1lA2RSY6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trmt1lA2RSY6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trmt1lA2RSY6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trmt1lA2RSY6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Trmt1lA2RSY6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trmt1lA2RSY6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trmt1lA2RSY6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trmt1lA2RSY6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trmt1lA2RSY6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trmt1lA2RSY6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trmt1lA2RSY6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trmt1lA2RSY6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Trmt1lA2RSY6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trmt1lA2RSY6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trmt1lA2RSY6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trmt1lA2RSY6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trmt1lA2RSY6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trmt1lA2RSY6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trmt1lA2RSY6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trmt1lA2RSY6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trmt1lA2RSY6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trmt1lA2RSY6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trmt1lA2RSY6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Trmt1lA2RSY6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Trmt1lA2RSY6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Trmt1lA2RSY6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trmt1lA2RSY6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms