Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2al1jA2BFR3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2al1jA2BFR3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2al1jA2BFR3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2al1jA2BFR3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2al1jA2BFR3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2al1jA2BFR3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2al1jA2BFR3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2al1jA2BFR3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2al1jA2BFR3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2al1jA2BFR3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2al1jA2BFR3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2al1jA2BFR3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2al1jA2BFR3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2al1jA2BFR3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2al1jA2BFR3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2al1jA2BFR3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2al1jA2BFR3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
H2al1jA2BFR3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2al1jA2BFR3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2al1jA2BFR3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2al1jA2BFR3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2al1jA2BFR3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2al1jA2BFR3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2al1jA2BFR3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2al1jA2BFR3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2al1jA2BFR3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
H2al1jA2BFR3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
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