Protein–RNA interactions for Protein: A2AT37

Upf2, UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf2A2AT37 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Upf2A2AT37 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Upf2A2AT37 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Upf2A2AT37 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Upf2A2AT37 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Upf2A2AT37 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Upf2A2AT37 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Upf2A2AT37 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Upf2A2AT37 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Upf2A2AT37 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Upf2A2AT37 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Upf2A2AT37 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Upf2A2AT37 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Upf2A2AT37 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Upf2A2AT37 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Upf2A2AT37 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Upf2A2AT37 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Upf2A2AT37 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Upf2A2AT37 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Upf2A2AT37 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Upf2A2AT37 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Upf2A2AT37 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Upf2A2AT37 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Upf2A2AT37 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Upf2A2AT37 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Upf2A2AT37 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Upf2A2AT37 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Upf2A2AT37 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Upf2A2AT37 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Upf2A2AT37 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Upf2A2AT37 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Upf2A2AT37 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Upf2A2AT37 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms