Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms