Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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