Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms