Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms