Protein–RNA interactions for Protein: A2AMM0

Cavin4, Caveolae-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin4A2AMM0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cavin4A2AMM0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cavin4A2AMM0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cavin4A2AMM0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cavin4A2AMM0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cavin4A2AMM0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cavin4A2AMM0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cavin4A2AMM0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cavin4A2AMM0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cavin4A2AMM0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cavin4A2AMM0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cavin4A2AMM0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cavin4A2AMM0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cavin4A2AMM0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cavin4A2AMM0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cavin4A2AMM0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cavin4A2AMM0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cavin4A2AMM0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cavin4A2AMM0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cavin4A2AMM0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cavin4A2AMM0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cavin4A2AMM0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cavin4A2AMM0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cavin4A2AMM0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cavin4A2AMM0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cavin4A2AMM0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cavin4A2AMM0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cavin4A2AMM0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cavin4A2AMM0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cavin4A2AMM0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cavin4A2AMM0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cavin4A2AMM0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cavin4A2AMM0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cavin4A2AMM0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cavin4A2AMM0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cavin4A2AMM0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cavin4A2AMM0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cavin4A2AMM0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cavin4A2AMM0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cavin4A2AMM0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cavin4A2AMM0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cavin4A2AMM0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cavin4A2AMM0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cavin4A2AMM0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cavin4A2AMM0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cavin4A2AMM0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cavin4A2AMM0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cavin4A2AMM0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cavin4A2AMM0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cavin4A2AMM0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cavin4A2AMM0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cavin4A2AMM0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms