Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms