Protein–RNA interactions for Protein: A2AKG8

Focad, Focadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FocadA2AKG8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FocadA2AKG8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FocadA2AKG8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FocadA2AKG8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FocadA2AKG8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FocadA2AKG8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FocadA2AKG8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FocadA2AKG8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FocadA2AKG8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FocadA2AKG8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FocadA2AKG8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FocadA2AKG8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FocadA2AKG8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FocadA2AKG8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FocadA2AKG8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FocadA2AKG8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FocadA2AKG8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FocadA2AKG8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FocadA2AKG8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FocadA2AKG8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FocadA2AKG8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FocadA2AKG8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FocadA2AKG8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FocadA2AKG8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FocadA2AKG8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FocadA2AKG8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FocadA2AKG8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FocadA2AKG8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FocadA2AKG8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FocadA2AKG8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FocadA2AKG8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FocadA2AKG8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FocadA2AKG8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FocadA2AKG8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FocadA2AKG8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FocadA2AKG8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FocadA2AKG8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FocadA2AKG8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FocadA2AKG8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FocadA2AKG8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FocadA2AKG8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FocadA2AKG8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FocadA2AKG8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FocadA2AKG8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FocadA2AKG8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FocadA2AKG8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FocadA2AKG8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FocadA2AKG8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FocadA2AKG8 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FocadA2AKG8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms