Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms