Protein–RNA interactions for Protein: A2AIV2

Virma, Protein virilizer homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VirmaA2AIV2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VirmaA2AIV2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
VirmaA2AIV2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VirmaA2AIV2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VirmaA2AIV2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VirmaA2AIV2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VirmaA2AIV2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VirmaA2AIV2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VirmaA2AIV2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VirmaA2AIV2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VirmaA2AIV2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
VirmaA2AIV2 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
VirmaA2AIV2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VirmaA2AIV2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VirmaA2AIV2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VirmaA2AIV2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VirmaA2AIV2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VirmaA2AIV2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VirmaA2AIV2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VirmaA2AIV2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VirmaA2AIV2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
VirmaA2AIV2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VirmaA2AIV2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
VirmaA2AIV2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VirmaA2AIV2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VirmaA2AIV2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
VirmaA2AIV2 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VirmaA2AIV2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VirmaA2AIV2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VirmaA2AIV2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VirmaA2AIV2 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VirmaA2AIV2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VirmaA2AIV2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VirmaA2AIV2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VirmaA2AIV2 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VirmaA2AIV2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VirmaA2AIV2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VirmaA2AIV2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VirmaA2AIV2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VirmaA2AIV2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VirmaA2AIV2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VirmaA2AIV2 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VirmaA2AIV2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VirmaA2AIV2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VirmaA2AIV2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VirmaA2AIV2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VirmaA2AIV2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VirmaA2AIV2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VirmaA2AIV2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VirmaA2AIV2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VirmaA2AIV2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VirmaA2AIV2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
VirmaA2AIV2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VirmaA2AIV2 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VirmaA2AIV2 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VirmaA2AIV2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
VirmaA2AIV2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VirmaA2AIV2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VirmaA2AIV2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VirmaA2AIV2 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VirmaA2AIV2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VirmaA2AIV2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VirmaA2AIV2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VirmaA2AIV2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VirmaA2AIV2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VirmaA2AIV2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VirmaA2AIV2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VirmaA2AIV2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VirmaA2AIV2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VirmaA2AIV2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VirmaA2AIV2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VirmaA2AIV2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VirmaA2AIV2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VirmaA2AIV2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VirmaA2AIV2 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VirmaA2AIV2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VirmaA2AIV2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VirmaA2AIV2 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VirmaA2AIV2 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VirmaA2AIV2 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VirmaA2AIV2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VirmaA2AIV2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VirmaA2AIV2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VirmaA2AIV2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VirmaA2AIV2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VirmaA2AIV2 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
VirmaA2AIV2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
VirmaA2AIV2 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VirmaA2AIV2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VirmaA2AIV2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VirmaA2AIV2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VirmaA2AIV2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VirmaA2AIV2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VirmaA2AIV2 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VirmaA2AIV2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VirmaA2AIV2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VirmaA2AIV2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VirmaA2AIV2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VirmaA2AIV2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
VirmaA2AIV2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms