Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pramel3A2AHA7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pramel3A2AHA7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pramel3A2AHA7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pramel3A2AHA7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pramel3A2AHA7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Pramel3A2AHA7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pramel3A2AHA7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pramel3A2AHA7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pramel3A2AHA7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pramel3A2AHA7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pramel3A2AHA7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pramel3A2AHA7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pramel3A2AHA7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pramel3A2AHA7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pramel3A2AHA7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pramel3A2AHA7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pramel3A2AHA7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Pramel3A2AHA7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pramel3A2AHA7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pramel3A2AHA7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pramel3A2AHA7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pramel3A2AHA7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pramel3A2AHA7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pramel3A2AHA7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pramel3A2AHA7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pramel3A2AHA7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pramel3A2AHA7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pramel3A2AHA7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pramel3A2AHA7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pramel3A2AHA7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pramel3A2AHA7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pramel3A2AHA7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pramel3A2AHA7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pramel3A2AHA7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pramel3A2AHA7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pramel3A2AHA7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pramel3A2AHA7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pramel3A2AHA7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pramel3A2AHA7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pramel3A2AHA7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pramel3A2AHA7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pramel3A2AHA7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pramel3A2AHA7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pramel3A2AHA7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pramel3A2AHA7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pramel3A2AHA7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pramel3A2AHA7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pramel3A2AHA7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pramel3A2AHA7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pramel3A2AHA7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pramel3A2AHA7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pramel3A2AHA7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 206.1 ms