Protein–RNA interactions for Protein: A2AF28

Slc25a53, MCG115034, isoform CRA_c, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc25a53A2AF28 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc25a53A2AF28 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc25a53A2AF28 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc25a53A2AF28 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc25a53A2AF28 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc25a53A2AF28 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc25a53A2AF28 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc25a53A2AF28 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc25a53A2AF28 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc25a53A2AF28 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc25a53A2AF28 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc25a53A2AF28 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc25a53A2AF28 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc25a53A2AF28 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc25a53A2AF28 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc25a53A2AF28 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc25a53A2AF28 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc25a53A2AF28 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Slc25a53A2AF28 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Slc25a53A2AF28 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Slc25a53A2AF28 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc25a53A2AF28 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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