Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms