Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Prdm16A2A935 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Prdm16A2A935 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Prdm16A2A935 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Prdm16A2A935 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Prdm16A2A935 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Prdm16A2A935 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Prdm16A2A935 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Prdm16A2A935 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Prdm16A2A935 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Prdm16A2A935 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Prdm16A2A935 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Prdm16A2A935 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Prdm16A2A935 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Prdm16A2A935 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Prdm16A2A935 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Prdm16A2A935 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Prdm16A2A935 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Prdm16A2A935 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Prdm16A2A935 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Prdm16A2A935 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Prdm16A2A935 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Prdm16A2A935 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Prdm16A2A935 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prdm16A2A935 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prdm16A2A935 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prdm16A2A935 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prdm16A2A935 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prdm16A2A935 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prdm16A2A935 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prdm16A2A935 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prdm16A2A935 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prdm16A2A935 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prdm16A2A935 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prdm16A2A935 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prdm16A2A935 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prdm16A2A935 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prdm16A2A935 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Prdm16A2A935 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prdm16A2A935 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prdm16A2A935 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prdm16A2A935 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prdm16A2A935 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prdm16A2A935 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prdm16A2A935 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prdm16A2A935 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prdm16A2A935 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prdm16A2A935 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prdm16A2A935 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Prdm16A2A935 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Prdm16A2A935 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prdm16A2A935 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Prdm16A2A935 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Prdm16A2A935 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Prdm16A2A935 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Prdm16A2A935 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Prdm16A2A935 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Prdm16A2A935 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Prdm16A2A935 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Prdm16A2A935 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Prdm16A2A935 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Prdm16A2A935 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Prdm16A2A935 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Prdm16A2A935 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prdm16A2A935 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prdm16A2A935 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prdm16A2A935 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prdm16A2A935 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prdm16A2A935 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Prdm16A2A935 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prdm16A2A935 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prdm16A2A935 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prdm16A2A935 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prdm16A2A935 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prdm16A2A935 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prdm16A2A935 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prdm16A2A935 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Prdm16A2A935 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prdm16A2A935 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prdm16A2A935 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prdm16A2A935 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prdm16A2A935 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prdm16A2A935 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prdm16A2A935 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prdm16A2A935 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prdm16A2A935 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prdm16A2A935 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prdm16A2A935 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prdm16A2A935 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prdm16A2A935 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prdm16A2A935 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prdm16A2A935 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prdm16A2A935 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Prdm16A2A935 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prdm16A2A935 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prdm16A2A935 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prdm16A2A935 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prdm16A2A935 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Prdm16A2A935 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Prdm16A2A935 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
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