Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prdm2A2A7B5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prdm2A2A7B5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prdm2A2A7B5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prdm2A2A7B5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prdm2A2A7B5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prdm2A2A7B5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Prdm2A2A7B5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prdm2A2A7B5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prdm2A2A7B5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prdm2A2A7B5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prdm2A2A7B5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prdm2A2A7B5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Prdm2A2A7B5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Prdm2A2A7B5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prdm2A2A7B5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prdm2A2A7B5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Prdm2A2A7B5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prdm2A2A7B5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prdm2A2A7B5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prdm2A2A7B5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prdm2A2A7B5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prdm2A2A7B5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prdm2A2A7B5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prdm2A2A7B5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prdm2A2A7B5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prdm2A2A7B5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prdm2A2A7B5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prdm2A2A7B5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prdm2A2A7B5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prdm2A2A7B5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prdm2A2A7B5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prdm2A2A7B5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Prdm2A2A7B5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prdm2A2A7B5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prdm2A2A7B5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prdm2A2A7B5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Prdm2A2A7B5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prdm2A2A7B5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prdm2A2A7B5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prdm2A2A7B5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prdm2A2A7B5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prdm2A2A7B5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prdm2A2A7B5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prdm2A2A7B5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Prdm2A2A7B5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prdm2A2A7B5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prdm2A2A7B5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prdm2A2A7B5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prdm2A2A7B5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prdm2A2A7B5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prdm2A2A7B5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prdm2A2A7B5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prdm2A2A7B5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prdm2A2A7B5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prdm2A2A7B5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prdm2A2A7B5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prdm2A2A7B5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prdm2A2A7B5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prdm2A2A7B5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prdm2A2A7B5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prdm2A2A7B5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Prdm2A2A7B5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prdm2A2A7B5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prdm2A2A7B5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prdm2A2A7B5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prdm2A2A7B5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prdm2A2A7B5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prdm2A2A7B5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Prdm2A2A7B5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prdm2A2A7B5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prdm2A2A7B5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prdm2A2A7B5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prdm2A2A7B5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prdm2A2A7B5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prdm2A2A7B5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prdm2A2A7B5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prdm2A2A7B5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prdm2A2A7B5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prdm2A2A7B5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prdm2A2A7B5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prdm2A2A7B5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Prdm2A2A7B5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prdm2A2A7B5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Prdm2A2A7B5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prdm2A2A7B5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Prdm2A2A7B5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prdm2A2A7B5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prdm2A2A7B5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prdm2A2A7B5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prdm2A2A7B5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prdm2A2A7B5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Prdm2A2A7B5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prdm2A2A7B5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Prdm2A2A7B5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prdm2A2A7B5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prdm2A2A7B5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prdm2A2A7B5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prdm2A2A7B5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prdm2A2A7B5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms