Protein–RNA interactions for Protein: A2A6A1

Gpatch8, G patch domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpatch8A2A6A1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Gpatch8A2A6A1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gpatch8A2A6A1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Gpatch8A2A6A1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gpatch8A2A6A1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gpatch8A2A6A1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Gpatch8A2A6A1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gpatch8A2A6A1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
Gpatch8A2A6A1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
Gpatch8A2A6A1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gpatch8A2A6A1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gpatch8A2A6A1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gpatch8A2A6A1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gpatch8A2A6A1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gpatch8A2A6A1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gpatch8A2A6A1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gpatch8A2A6A1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Gpatch8A2A6A1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gpatch8A2A6A1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gpatch8A2A6A1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Gpatch8A2A6A1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gpatch8A2A6A1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gpatch8A2A6A1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gpatch8A2A6A1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gpatch8A2A6A1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gpatch8A2A6A1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gpatch8A2A6A1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Gpatch8A2A6A1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gpatch8A2A6A1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gpatch8A2A6A1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gpatch8A2A6A1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gpatch8A2A6A1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gpatch8A2A6A1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gpatch8A2A6A1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gpatch8A2A6A1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gpatch8A2A6A1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gpatch8A2A6A1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gpatch8A2A6A1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gpatch8A2A6A1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gpatch8A2A6A1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gpatch8A2A6A1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Gpatch8A2A6A1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gpatch8A2A6A1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gpatch8A2A6A1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gpatch8A2A6A1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gpatch8A2A6A1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Gpatch8A2A6A1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gpatch8A2A6A1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gpatch8A2A6A1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gpatch8A2A6A1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gpatch8A2A6A1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Gpatch8A2A6A1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Gpatch8A2A6A1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Gpatch8A2A6A1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Gpatch8A2A6A1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gpatch8A2A6A1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gpatch8A2A6A1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gpatch8A2A6A1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gpatch8A2A6A1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gpatch8A2A6A1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gpatch8A2A6A1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gpatch8A2A6A1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gpatch8A2A6A1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gpatch8A2A6A1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gpatch8A2A6A1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Gpatch8A2A6A1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Gpatch8A2A6A1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gpatch8A2A6A1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gpatch8A2A6A1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gpatch8A2A6A1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gpatch8A2A6A1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Gpatch8A2A6A1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gpatch8A2A6A1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Gpatch8A2A6A1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gpatch8A2A6A1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gpatch8A2A6A1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Gpatch8A2A6A1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gpatch8A2A6A1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Gpatch8A2A6A1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gpatch8A2A6A1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Gpatch8A2A6A1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gpatch8A2A6A1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gpatch8A2A6A1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gpatch8A2A6A1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gpatch8A2A6A1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gpatch8A2A6A1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gpatch8A2A6A1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Gpatch8A2A6A1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Gpatch8A2A6A1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gpatch8A2A6A1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gpatch8A2A6A1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gpatch8A2A6A1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gpatch8A2A6A1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gpatch8A2A6A1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gpatch8A2A6A1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gpatch8A2A6A1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gpatch8A2A6A1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gpatch8A2A6A1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gpatch8A2A6A1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gpatch8A2A6A1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms