Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms