Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2P7S8

Uncharacterized protein, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2P7S8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A1W2P7S8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A1W2P7S8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A1W2P7S8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A1W2P7S8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A1W2P7S8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A1W2P7S8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A1W2P7S8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A1W2P7S8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A1W2P7S8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A1W2P7S8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A1W2P7S8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A1W2P7S8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A1W2P7S8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A1W2P7S8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A1W2P7S8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A1W2P7S8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A1W2P7S8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A1W2P7S8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A1W2P7S8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A1W2P7S8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A1W2P7S8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A1W2P7S8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A1W2P7S8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A1W2P7S8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A1W2P7S8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A1W2P7S8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A1W2P7S8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A1W2P7S8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A1W2P7S8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A1W2P7S8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A1W2P7S8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A1W2P7S8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A1W2P7S8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A1W2P7S8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A1W2P7S8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A1W2P7S8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A1W2P7S8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A1W2P7S8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A1W2P7S8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A1W2P7S8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A1W2P7S8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A1W2P7S8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A1W2P7S8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A1W2P7S8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A1W2P7S8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A1W2P7S8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A1W2P7S8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A1W2P7S8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A1W2P7S8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A1W2P7S8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A1W2P7S8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A1W2P7S8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A1W2P7S8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
A0A1W2P7S8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A1W2P7S8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A1W2P7S8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A1W2P7S8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A1W2P7S8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A1W2P7S8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A1W2P7S8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A1W2P7S8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A1W2P7S8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A1W2P7S8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A1W2P7S8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A1W2P7S8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A1W2P7S8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A1W2P7S8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A1W2P7S8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A1W2P7S8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A1W2P7S8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A1W2P7S8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A1W2P7S8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A1W2P7S8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A1W2P7S8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A1W2P7S8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A1W2P7S8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1W2P7S8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1W2P7S8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1W2P7S8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1W2P7S8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1W2P7S8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1W2P7S8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1W2P7S8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1W2P7S8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1W2P7S8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1W2P7S8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1W2P7S8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1W2P7S8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1W2P7S8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1W2P7S8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1W2P7S8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1W2P7S8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1W2P7S8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1W2P7S8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1W2P7S8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A1W2P7S8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A1W2P7S8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A1W2P7S8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A1W2P7S8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms