Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXN4

Ighv1-18, Immunoglobulin heavy variable V1-18 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Ighv1-18A0A0A6YXN4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Ighv1-18A0A0A6YXN4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
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Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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